Várias enchentes, ao longo dos anos, marcaram a história de Nova Venécia. Três delas deixaram grandes estragos.
No ano de 1969, as fortes chuvas e o grande vendaval culminaram com a queda da então, famosa Casa de Farinha, que existia onde hoje funciona a Unidade de Saúde Ângelo Piassaroli, no bairro Margareth.
Em 2013, (registrada por A Notícia), a situação foi ainda pior e a passarela que existia nas imediações da rodoviária ligando a avenida São Mateus ao centro da cidade, foi levada pela correnteza.
Recentemente, no final do ano passado, as chuvas registradas no dia 13 de dezembro, também registradas por A Notícia, provocou grandes estragos mas em menor proporção que as de 1969 e de 2013.